冷卻塔在日常使用時都是暴露在空氣中，空氣中有很多的懸浮物、塵埃、雜質(zhì)會不斷的堆積在冷卻塔中，所以冷卻塔會出現(xiàn)污垢沉淀。冷卻水系統(tǒng)內(nèi)也會滋生大量生物藻泥，造成堵塞現(xiàn)象。

在冬季的時候，冷卻塔很少需要使用。而冷卻塔中會積累大量的水分，冷卻塔中的水分就會對冷卻塔的內(nèi)部造成一定的腐蝕，時間久了，就會腐蝕物質(zhì)堆積，導(dǎo)致局部的腐蝕情況非常嚴(yán)重。

冷卻塔循環(huán)水內(nèi)含無機鹽、有機物和微生物等，在某些季節(jié)水溫能達(dá)到35℃以上，若冷卻水長期使用不更換或水量補充不足，以及長時間不清洗消毒或消毒不徹底等，就會滋生很多細(xì)菌，其中典型的細(xì)菌是“軍團菌”，這種細(xì)菌會造成傳染病。在冷卻塔的冷卻水中大量繁殖并形成微生物氣溶膠，部分直接飄逸到冷卻塔周圍的空氣中，使周圍800米內(nèi)都會受到影響。所以，城市的冷卻塔是城市污染的一種主要來源。